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IBM、微软联合白宫部署超级计算机,对抗冠状病毒

大数据文摘出品

来源:venturebeat、cnbc、ibm

编译:牛婉杨

在中国疫情爆发时期,我国同众多科技公司一起抗击病毒,效果显著。现在,轮到美国了。

3月22日,特朗普政府表示,IBM正在与白宫合作,提供大量的超级计算能力,以帮助研究人员制止冠状病毒的蔓延。

根据IBM研究主管Dario Gil的一份声明,IBM已与白宫科学技术政策办公室以及美国能源部合作启动了COVID-19高性能计算(HPC)联盟。为研究COVID-19的科学家提供超过330千万亿次(330 petaflops)的计算能力。

超级计算能力将可帮助研究人员开发预测模型,以分析疾病的发展过程,并在开发可能的疫苗过程中模拟潜在的治疗方法

这些高性能计算系统允许研究人员在流行病学、生物信息学和分子建模中进行大量的计算。如果手工操作,这些实验需要数年才能完成,如果在速度较慢的传统计算平台上完成,则需要数月时间。

IBM研究总监Dario Gil在声明中写道,“我们一直在与美国和世界各国政府密切合作,寻找一切可能的办法,把我们的技术和专业知识运用到工作中,帮助各组织有能力应对和适应冠状病毒疫情带来的影响。”

超级计算能力将提供给最有可能产生直接影响的项目 

COVID-19高性能计算(HPC)联盟将审查来自世界各地的研究计划,并将超级计算能力提供给最有可能产生直接影响的项目,为研究人员提供技术援助。获得超级计算能力的团队可以使用16个系统,这些系统结合了77.5万个处理器内核和3.4万个GPU,它们每秒可执行约330千万亿次浮点运算(330 petaflops)。

微软人工智能健康项目全球负责人John Kahan表示:“我们要确保致力于对抗COVID-19的研究人员能够使用他们所需的工具。”“通过人工智能健康项目,我们已经亲眼目睹了利用强大的技术为才华横溢的研究人员赋能后的影响。我们希望通过扩大对Azure云和高性能计算功能的访问,创造与更多数据科学家合作的机会,来帮助加快这项重要工作。”

亚马逊表示,它将为使用亚马逊网络服务(AWS)项目的研究机构和公司提供技术支持,以推进COVID-19在诊断、治疗和疫苗研究方面的研究。AWS全球公共部门副总裁Teresa Carlson说:“我们很自豪能够支持这项关键的工作,并随时准备利用AWS的计算能力帮助加速研发工作。”“政府、企业和学术领袖可以共同努力,利用云的力量来推动科学发现和创新的步伐,并帮助抗击COVID-19病毒。”

伦斯勒理工学院将把其人工智能多处理优化系统(AiMOS)计算机部署在伦斯勒计算创新中心(Rensselaer Center For Computational Innovations),与全球第24强超级计算机展开对抗。Rensselaer中心表示,正在接触研究机构,包括政府机构、大学和业界,为AiMOS提供支持,以支持与COVID-19有关的研究。

谷歌云全球公共部门副总裁Mike Daniels在一份声明中说,“我们知道,高性能计算可以减少处理大量数据集和执行复杂模拟所需的时间,从几天到几个小时。我们期待着与技术、学术界和公共部门的领导者一起参与这个项目,为COVID-19的研究人员提供更多的资源,并将谷歌云计算能力应用于潜在的治疗和疫苗的开发。”

目前COVID-19高性能计算(HPC)联盟包括:白宫科技政策办公室,美国能源部,麻省理工学院,伦斯勒理工学院,劳伦斯利弗莫尔国家实验室,阿贡国家实验室,橡树岭国家实验室,桑迪亚国家实验室,洛斯阿拉莫斯国家实验室,美国国家航空航天局(NASA)和美国国家科学基金会,IBM,微软,谷歌,惠普和亚马逊。

如果有团队也想加入,可以通过网站申请,前提是他们必须说明国家实验室或其他机构的工作人员的支持对他们的项目而言是否是必不可少的,有帮助的还是不必要的,以及是否可能存在任何限制,如专有数据集或HIPAA限制。

COVID-19 HPC联盟:https://www.xsede.org/covid19-hpc-consortium?mod=article_inline

被寄与厚望的超级计算机,它能够缩短新药上市时间吗?

最近,全球最大的众包超级计算程序之一Folding@home启动了一项行动,旨在揭开COVID-19的spike蛋白背后的秘密,这种病毒利用蛋白来感染细胞。据该项目的组织者、华盛顿大学医学院生物化学和分子生物物理学副教授Greg Bowman介绍,自2月底宣布将把重点放在冠状病毒上以来,约有40万名新志愿者加入了这项工作。

长期以来,超级计算机一直被用于识别和测试复杂和慢性疾病的潜在治疗方法。研究人员利用德州高级计算中心的Lonestar5集群来模拟1400多种fda批准的药物,看看它们是否可以用来治疗癌症。去年6月,欧盟挑选了8个超级计算中心来承载个性化医疗和药物设计方面的应用。制药公司TwoXAR最近与斯坦福大学亚洲肝脏中心合作,筛选25,000种可能用于治疗成人肝癌的药物。

人们希望超级计算机能够缩短新药上市所需的时间。因为药物从发现到上市至少需要10年的时间,何况在所有进入临床试验的药物中,最终只有不到12%能够进入药店。根据美国制药研究与制造商协会(Pharmaceutical Research and Manufacturers of America)的数据,单是临床试验就平均需要六到七年的时间,研发成本因此增加到约26亿美元。

美国首席技术官Michael Kratsios在昨天的新闻中说:“美国正团结起来与COVID-19作战,这意味着我们要释放我们的世界级超级计算机的全部能力,以迅速推进治疗和疫苗的科学研究。我们感谢私营部门和学术领袖加入联邦政府,作为美国应对措施的一部分。”

相关报道:https://venturebeat.com/2020/03/22/ibm-coronavirus-covid-19-supercomputing-consortium/https://www.cnbc.com/2020/03/22/ibm-and-white-house-to-deploy-supercomputers-to-fight-coronavirus.htmlhttps://newsroom.ibm.com/IBM-helps-bring-supercomputers-into-the-global-fight-against-COVID-19

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